Коити Сакакибара переводится в среднюю школу Йомияма после переезда в город Йомияма в связи с работой его отца. Его перевод совпадает с его пребыванием в больнице из-за пневмоторакса, где он впервые встречается с загадочной девочкой по имени Мэй Мисаки. После выписки и начала занятий в классе 3-3, Коити немедленно ощущает напряженную и необычную атмосферу, окружающую его новый класс.
Его одноклассники и учителя ведут себя странно, а сама Мэй Мисаки, кажется, полностью игнорируется всеми, словно ее не существует. Естественно любопытный и прямой, Коити не может смириться с этим молчанием и пытается выяснить причину такого поведения. Он задает вопросы, но получает лишь уклончивые ответы или полные молчания.
Коити быстро погружается в тайну, связанную с его классом и городом. Он старается разобраться в сложных социальных правилах и невысказанных запретах, которые, по всей видимости, существуют в Йомияма. Его стремление понять, что происходит, ведет его к Мэй Мисаки, которая становится для него единственной зацепкой в этой запутанной паутине загадок. Коити — это своего рода проводник для зрителя, который вместе с ним исследует пугающие реалии Йомияма, пытаясь найти логическое объяснение происходящему. Он наблюдателен, аналитичен и не боится задавать неудобные вопросы, несмотря на предостережения окружающих.